In stazione idrobiologica ci sono i seguenti laboratori e attrezzature:
- 2 stanze acquari condizionate con vasche in vetro di diversa capienza, fotoperiodo regolabile, sistema di aerazione.;

- 1 stanza condizionata per dissezioni;

- 1 stanza condizionata per analisi sedimenti e benthos;

- 1 stanza termostatata;

- vasche esterne per stabulazione;

- laboratorio di chimica: cappa aspirante, sonde multiparametriche per misurazione di temperatura, ossieno disciolto, salinità, torbidità e pH, bilancia analitica a 3 e 4 decimali, centrifughe refrigerate (con rotori per micro piastre e tubi da 2ml, 15 ml e 50ml);

- laboratorio di ecologia: fluorimetro subacqueo DIVING PAM-II, mini-ROV, sistema di rilevazione GNSS;

- laboratorio di granulometria e analisi elementale: gascromatografo CHNS/O analyser, Coulter Counter, granulometro  laser in fase liquida, microbilancia a 5 decimali;

- laboratorio di istologia: cappa aspirante, binoculari da dissezione, microscopi, stufe, microtomo, vaschette per colorazione, inclusore in paraffina, levigatrice per otoliti;

- laboratorio di microscopia: stereomicroscopi, microscopo ottici e a fluorescenza; sistema di analisi d'immagine LAS X Suite;

- sistema per la distillazione e deionizzazione dell'acqua;

- attrezzature per campionamenti: attrezzatura subacquea completa (erogatori, bombole, compressore per la ricarica), retini da zooplancton, bottiglia da campionamento di tipo Van Dohrn, raschietti, reti, setacci, sgorbie, essiccatori, box-corer e carotatori;

- autoclave, armadio termostatato con illuminazione a fluorescenza, liofilizzatore, lavavetreria industriale;